Činnost odboru obecně vymezují zákon o Ústředním kontrolním a zkušebním ústavu a odborné zákony a právní předpisy ES související s certifikací a kontrolou osiva a sadby pěstovaných rostlin a sazenic zeleniny, ochrany práv k odrůdám rostlin a nakládání s geneticky modifikovanými organizmy a produkty a ekologickým zemědělstvím.