Na 17 zkušebních stanicích umístěných ve významných zemědělských výrobních oblastech zajišťuje činnosti pro jednotlivá pracoviště Ústavu:

- pro Národní odrůdový úřad zakládá a hodnotí pokusy pro ochranu práv k odrůdám, registraci a doporučování odrůd,
- pro odbor osiv a sadby zakládá a hodnotí vegetační zkoušky vybraných druhů rostlin,¨
- v oblasti trvalých kultur udržuje kolekce odrůd vybraných ovocných druhů,
- zakládá a hodnotí stacionární pokusy AZP

Ve spolupráci se Státní rostlinolékařskou správou provozuje síť automatických meteorologických stanic a sacích pastí hmyzu.